在巴丹吉林沙漠內,沙山沙丘、風蝕洼地、剝蝕山丘、湖泊盆地和谷地交錯分佈,並以流動沙丘為主,約佔沙漠總面積的83%,流沙面積僅次於新疆的塔克拉瑪幹沙漠。沙漠中部是高度約為200—300米的複合型沙山,形態複雜,高大密集,最高的巴彥諾爾、吉訶德沙山高度達500米以上,是世界上最高的沙丘。
雖然氣候極為乾旱,卻不是人們的想象的那樣沒有一滴水,巴丹吉林沙漠內有着許多的湖泊。據統計,在沙漠之中、沙丘之間,分佈有面積在1.5平方公里以下的沙漠湖泊140多個,多以鹹水湖為主,這些湖泊最深的可達水深6米以上,在沙漠的西部和北部,還有兩個較大的湖盆,西部南北走向的古魯乃湖約180公里長,10公里寬,北部的拐子湖東西走向,約100公里長,6公里寬,湖濱地帶水分涵養較好。此外,在沙漠中還有多處泉水涌出,水質清澈,甘甜可口,可供人蓄飲用。
位於內蒙古烏海地區的烏蘭布和沙漠部分與黃河漠水相連,每當夕陽西下,麟波閃閃,“長河落日”、“大漠孤煙”,構成一幅瑰麗多姿的塞上風景畫。
現在的恩格貝已發展成為集沙漠珍禽動物觀賞、大漠風景觀賞、 生態農業觀賞、沙生植物觀賞和游客休閒渡假綜合服務為一體的沙漠生態旅游區,開發了植樹旅游、觀沙漠綠洲、觀珍稀 動物和水上娛樂等旅游項目,形成了五大旅游景區,二十余個旅游景點。其中的“漠中河”長3.5公里,乘塊艇或蕩舟隨着沙丘的婉延曲折直入沙漠腹地,堪稱天下一絕。
恩格貝生態旅游區獨特的天然沙漠風景,景觀壯美,風景獨特,700公里黃河呈無比巨大的“幾”字形,宛如弓背,迤儷東去的茫茫沙漠,宛如一束弓弦,組成了具大的金弓形。大漠浩瀚,長河如帶,沙海茫茫,朝日渾圓,氣魄宏大,如詩如畫。諸多的沙漠自然神奇景觀,原汁原味的大漠風光,能給人以發自內心的振撼。