原題:我國首個全自動核酸蛋白共提取平台在三亞投用
樣本處理效率較人工提升超10倍
近日,我國首個全自動核酸蛋白共提取平台在三亞崖州灣科技城投用。該平台由上海交通大學海南研究院、深部生命國際研究中心三亞崖州灣研究基地提供原創實驗技術、華大集團定制開發。樣本處理通量和效率與人工操作相比提升10倍以上,實驗成本指數級降低。
全自動核酸蛋白共提取系統通過全自動機械臂整合不同儀器模塊,採用工位流水線設計理念,用於各類生物樣本的蛋白、核酸自動化高通量共提取,實現從一份樣本中同時提取出核酸和蛋白並完成肽段製備,並記錄過程産生的實驗數據,高效智能地對接下游的核酸建庫、測序、質譜檢測等實驗流程,産生多組學大數據並進行宏組學聯動分析。該平台尤其適用於深海微生物樣本等低生物量的珍貴樣本提取,有助於提高實驗效率、縮短數據産生周期,便於及時反饋科研結果並加快各類生物資源開發進度。
上海交通大學海南研究院、深部生命國際研究中心科研人員章陶亮透露,人工操作核酸蛋白共提取實驗,一份樣本從提取到拿到核酸和蛋白(不包括DNA建庫和製備肽段)需要一天半的時間,一次僅能完成8個深海環境微生物樣本的提取,而自動化核酸蛋白共提取平台可同時進行2個96孔板的交替提取,在相同時間段內一次就能夠完成192個樣本的提取。
上海交通大學海南研究院教授、深部生命國際研究中心主任肖湘&&,深部生命國際研究中心崖州灣研究基地全力建設全新一代深海微生物綜合研究平台,圍繞深海微生物資源的採集、培養、挖掘、開發等關鍵技術環節,建設自動化樣本庫與菌株庫、高通量核酸蛋白共提取系統、高通量厭氧微生物分離培養系統等全國産化技術與硬體設備,在海南率先實現深海微生物資源獲取和開發的數字化與智能化。其中,全自動核酸蛋白共提取平台等系列自動化科研平台的建設,將推動深海微生物菌種獲取速度提升10倍、産生數據的效率提升百倍,標準化、高效化、智能化的平台建設將有力推動海南深海微生物資源産業化發展進程。(海南日報全媒體記者黃媛艷)








