時隔30年後，普定穿洞再次啟動考古工作，隨着地層的深入，考古工作者們又發掘出和30年前相同的、碎成多片的頭蓋骨。在2023年底的考古現場，考古工作者們再次揭開穿洞人洞穴生活的神秘面紗。
與30年前一樣，地層中的頭骨化石同樣被大石板壓成了碎片，隨着考古發掘的深入，考古人員發現這樣的現象不是自然形成的，而是存在人為因素。
在發現頭蓋骨碎片的地方，還發現有研磨赭石的石器，以及精美的魚鉤，也許在穿洞中已經産生了二次葬的行為。
這件圓形穿孔飾物由蚌殼所制，考古工作者推測這很有可能是項鏈一類的挂飾。在生産力低下的舊石器時期，穿洞人是如何生産出這樣小巧精緻的裝飾物的，令人十分疑惑。
在這次考古發掘中，考古工作者們，在30年前的基礎上，共發掘了13個地層，每個地層中都有不同的遺跡和遺物，地層之間時間跨度較大，受當時氣候變遷，這裡應該不止一個族群生活過，可能穿洞像一個驛站一樣，迎來送往着不同時期暫居於此的先民們。
為了得到每一個文化層的確切時間，貴州考古所邀請了北京大學光釋光實驗室來對地層進行測年。
2023年底，穿洞的考古接近尾聲，貴州考古所專家張興龍為了讓考古隊員們理解穿洞人當時的生活，特意組織了一場模擬穿洞人生活的實驗。
